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DNA上樣染料用於琼脂糖或聚丙烯酰胺膠中追蹤DNA遷移。
6X DNA上樣染料 – 成分
| 名稱 | 分子式 | 濃度 | CAS號 |
|---|---|---|---|
| Tris-Cl (pH 7.6) | C₄H₁₁NO₃ | 10 mM | 77-86-1 |
| EDTA | C₁₀H₁₆N₂O₈ | 60 mM | 60-00-4 |
| Orange G | C₁₆H₁₀N₂Na₂O₇S₂ | 0.4% (w/v) | 1936-15-8 |
| 溴酚藍 | C₁₉H₁₀Br₄O₅S | 0.25% (w/v) | 115-39-9 |
| 二甲苯氰FF | C₂₅H₂₇N₂NaO₆S₂ | 0.25% (w/v) | 2650-17-1 |
| Ficoll 400 | (C₁₂H₂₂O₁₁)n·(C₃H₅ClO)n | 15% (w/v) | 26873-85-8 |
滅菌與儲存
- 滅菌：無需滅菌。
- 儲存：分裝1 mL，4 °C或−20 °C保存。
操作提示
- DNA上樣緩衝液有多種配方，此處僅列舉其中一種。
- 加入染料前（至第4步），溶液可能呈無色透明至淡黃色混濁。
- 配製小體積溶液（如10 mL）時，定容前請確認管壁及管蓋上無殘留溶液。
- 請選擇合適容器，盡量在同一容器中完成整個操作流程，因溶液較黏稠，不利於移液。
- 染料濃度可依需求調整：溴酚藍與二甲苯氰FF 0.03%–0.50%（w/v）；Orange G 0.15%–0.50%（w/v）。
- 高濃度染料可提供較佳對比色，但可能遮蔽共遷移DNA條帶；預期有共遷移DNA片段時建議低濃度染料。
- Ficoll 400可用60%（v/v）甘油或40%（w/v）蔗糖替代；使用蔗糖溶液需冷凍保存。
- 含Ficoll 400的上樣染料可使DNA樣品更有效沉入琼脂糖，但成本較高。
- 三色上樣染料可更清楚指示DNA片段分辨率，但成本亦較高。
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