DNA上样染料(3色) 制备指南

本指南介绍了如何制备实验室使用的特定摩尔浓度的 DNA上样染料(3色)。

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DNA上样染料用于琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶中追踪DNA迁移。

6X DNA上样染料 – 成分

名称分子式浓度CAS号
Tris-Cl (pH 7.6)C₄H₁₁NO₃10 mM77-86-1
EDTAC₁₀H₁₆N₂O₈60 mM60-00-4
Orange GC₁₆H₁₀N₂Na₂O₇S₂0.4% (w/v)1936-15-8
溴酚蓝C₁₉H₁₀Br₄O₅S0.25% (w/v)115-39-9
二甲苯腈蓝FFC₂₅H₂₇N₂NaO₆S₂0.25% (w/v)2650-17-1
Ficoll 400(C₁₂H₂₂O₁₁)n·(C₃H₅ClO)n15% (w/v)26873-85-8

灭菌与储存

  • 灭菌:无需灭菌。
  • 储存:分装1 mL,4 °C或−20 °C保存。

操作提示

  • DNA Loading Buffer有多种配方,此处仅列举一种。
  • 未添加染料前(至第4步),溶液可能呈现无色透明至黄色浑浊状态。
  • 配制小体积溶液(如10 mL)时,定容前请确保管壁及管盖无残留溶液。
  • 请选择合适容器,尽量在一个容器内完成操作,因为溶液较粘稠,不易移液。
  • 染料浓度可自行调整:溴酚蓝和二甲苯腈蓝FF 0.03%–0.50% (w/v);Orange G 0.15%–0.50% (w/v)。
  • 高浓度染料提供更好对比色,但可能遮蔽共迁移DNA条带;预期有共迁移DNA片段时建议低浓度染料。
  • Ficoll 400可用60% (v/v)甘油或40% (w/v)蔗糖替代;蔗糖溶液需冷冻保存。
  • 含Ficoll 400的上样染料能更有效沉入琼脂糖,但成本较高。
  • 三色上样染料能更清晰指示DNA片段分辨率,但成本亦较高。
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